一个人有23对染色体，也就是46条，同一对染色体同一位置上的一对基因称为等位基因，一般一个来自父亲，一个来自母亲。
DNA亲子鉴定就类似于一个对号入座的过程，利用人类基因组中的短串联重复序列（STR又称微卫星DNA）的重复数，一一排除不匹配之后，就可以确定两人之间的亲生关系。
如果DNA位点检测全部一样，就可以确定亲子关系；如果有3个以上的位点不同，则可排除亲子关系；有一两个位点不同，则应考虑基因突变的可能，加做一些位点的检测进行辨别。
DNA亲子鉴定，否定亲子关系的准确率几近100%，肯定亲子关系的准确率高达99.9999%。
DNA亲子鉴定测试与传统的血液测试有很大的不同。它可以在不同的样本上进行测试，包括血液，口腔黏膜细胞，带毛囊的头发，精液，指甲，烟蒂，口香糖等等。
由于血液型号，例如A型，B型，O型或RH型，在人群中的运用比较普遍，用来分辨每一个人的血缘关系，但不如DNA亲子鉴定测试有效。除了真正同卵双胞胎外，每人的DNA是独一无二的。由于它是这样独特，所以DNA亲子鉴定是最准确的亲子鉴定方法。
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