子宫环境，子宫是孕育胚胎的。住所，一个良好的子宫环境将直接影响胚胎的发育。子宫肌瘤、子宫内膜异位症、子宫内膜过薄或者过厚、宫腔粘连、先天性宫颈口松弛均可能是导致胚胎中止发育的因素。内分泌失调，女性自身的内源性激素不足，比如黄体功能不足，孕激素分泌不足就有可能造成胚胎的停育和流产。环境因素，孕妈妈在孕前或者孕后大量的接触了X射线、微波、噪音、超声、高温等物理因素，诸如铝、铅、汞、锌这样的重金属也是影响受精卵着床的因素。
染色体异常，染色体异常是导致胚胎停止发育的重要因素，但是这毕竟是极少数的人，但如果确实是此原因，则不能怀孕。染色体的缺陷目前尚未有很好的解决办法。不良的生活习惯，很多国家的调查数据表明抽烟酗酒对胎儿的发育存在很大的危害，女性抽烟酗酒会直接影响女性内分泌及生殖系统功能，孕妈妈抽烟酗酒则会导致胎儿畸形的发生。
生殖道感染，妊娠早期严重的TDRCH感染可引起胚胎死亡或流产，较轻感染亦可引起胚胎畸形。研究表明巨细胞病毒可引起过期流产、胎死宫内等。母体发生感染后病原体可通过血行使胎盘感染，引起绒毛膜和毛细血管内皮受损，破坏胎盘屏障，病原体进入胎儿导致流产、胚胎停止发育及胎儿畸形图。许多研究表明支原体感染与胚胎停止发育有关，胚胎停止发育妇女宫颈分泌物支原体感染阳性率明显高于正常妇女，并有极显著差异。
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