引起习惯性流产的原因很多，目前已证实于妊娠早期发生习惯性流产者，60%以上是由于孕妇或爱人存在遗传基因缺陷或外界不良环境如放射、药物等影响而导致胚胎染色体异常所造成。此外，习惯性早期流产的原因还有黄体功能不全、甲状腺功能减退、子宫畸形、子宫腔粘连、子宫肌瘤等；习惯性晚期流产最常见的原因是子宫颈内口松弛，后者可因先天性发育异常，也可因分娩、刮宫或子宫颈手术造成，这种妇女常在妊娠中期突然发生胎膜破裂，羊水流出，随即短期内胎儿排出。检查排出的胎儿会发现胎儿生长发育都正常且是活胎，另外，梅毒感染也可导致习惯性晚期流产，这种流产的胎儿都是死胎。
患习惯性流产的妇女在前次流产后，下次妊娠前，应与丈夫一起到医院进行详细的检查，找出病因，然后针对病因进行治疗，因黄体功能不全、甲状腺功能减退等疾患引起的可给药物治疗；因子宫畸形、子宫肌瘤、宫腔粘连引起的可行手术治疗。目前对染色体异常尚无特殊的治疗办法，所以这些夫妇最好采取避孕措施，避免妊娠，如一定要生育，就必须在妊娠4-5个月到医院抽羊水检查胎儿脱落细胞有无染色体异常或用B超检查，一经发现胎儿异常立即终止妊娠。因子宫颈内口松弛引起的习惯性晚期流产可在妊娠12-20周，以往发生流产的妊娠月份前到医院进行子宫颈内口缝扎手术以紧缩子宫颈内口，手术后在医院卧床休息至以往发生流产的妊娠月份之后，妊娠足月时拆除子宫颈的缝扎线。对病因不明的习惯性流产妇女，在月经稍有过期，疑有妊娠可能时即应卧床禁性生活、补充维生素B、C、E，口服镇静剂，消除精神紧张，其卧床、用药时间必须超过以往发生流产的妊娠月份。
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