首先是泌尿生殖道感染：潜伏期为1～3周，典型的急性期症状与其他非淋病性生殖泌尿系统感染相似，表现为尿道刺痛，不同程度的尿急及尿频，排尿刺痛，特别是当尿液较为浓缩的时候明显，尿道口轻度红肿，分泌物稀薄，量少，为浆液性或脓性，多需用力挤压尿道才见分泌物溢出，常于晨起尿道口有少量黏液性分泌物或仅有痂膜封口，或见污秽裤裆，亚急性期常合并前列腺感染，患者常出现会阴部胀痛，腰酸，双股内侧不适感或在做提肛动作时有自会阴向股内侧发散的刺痛感，
女性患者多见以子宫颈为中心扩散的生殖系炎症，多数无明显自觉症状，少数重症病人有阴道坠感，当感染扩及尿道时，尿频，尿急是引起病人注意的主要症状，感染局限在子宫颈，表现为白带增多，混浊，子宫颈水肿，充血或表面糜烂，感染扩及尿道表现为尿道口潮红，充血，挤压尿道可有少量分泌物外溢，但很少有压痛出现。
即使怀孕也很容易导致胚胎夭折、胎儿死亡、自然流产、低体重儿等。女性感染人型支原体，还可以引起肾盂肾炎、盆腔炎流产后发热，产后发热、非淋球菌尿道炎等疾病。
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