对于肺炎类的疾病，很多时候都会选择用抗生素类的药品进行治疗，抗生素类的药品可以选用青霉素类、头孢菌素或其他类属的药物，并可参考致病菌的药物敏感试验结果选用。肺炎双球菌肺炎可用青霉素G治疗，每日80～160万单位，分2～4次肌肉注射，一般疗程为7天。青霉素过敏者，可选用红霉素，四环素等。也可用磺胺。多数患者在用药48小时后体温可迅速降至正常。病人要卧床休息，吃易消化、高营养的食物，多饮水。
另外，还可以通过注射疫苗对肺炎双球菌进行预防。由2000年开始，美国建议使用一种七价的肺炎链球菌结合疫苗，如沛儿，适合2-23个月大的婴儿或2-5岁有存在风险的孩童。这种疫苗每2、4、6及12-14个月大会使用一次。可以保护孩童免受肺炎链球菌的深层感染，如败血病及脑膜炎。肺炎链球菌多糖疫苗(如“纽莫法”)可以对55岁以上的人提供达85%的五年保护。建议是那些有高感染风险的人接受接种，包括65岁或以上的长者，而往往都只是接受一次接种就能有终生的保护。标准的23价疫苗对两岁以下的孩童则没有功用。美国医师协会现时的指引是2-65岁的人都需要接受疫苗，而若于60岁前已接种，则须接受多一次的疫苗接种。若是无脾或肾病综合症则须定期进行接种。
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