肺炎支原体进入宝宝体内后并不立即引起症状，在潜伏了约2～3周后才会引起症状。宝宝主要表现为全身不适，食欲不振等。
后来随着病情的不断加重，会伴有头痛、畏寒和疲乏等症状。
发热：多数在39摄氏度左右。可为持续性或弛张性，或仅有低热，甚至不发热。
咳嗽：多为重咳，初期干咳，继而分泌痰液（偶含小量血丝），有时阵咳稍似百日咳。初期宝宝咳嗽少痰，呈干咳状，以后逐渐转成顽固性的剧烈咳嗽，伴有少量黏液样痰，特别在夜间咳得很厉害，有点像百日咳。婴幼儿表现出喘憋和呼吸困难。
有的患儿无明显的咳嗽，而以高热，寒战和咽痛症状为主。肺炎支原体还会引起其他系统和器官的病变，如麻疹样皮疹，肌痛，游走性关节疼痛，肝功能损害，溶血性贫血，脑膜脑炎，心肌炎，心包炎，肾炎等。
PS：但支原体检测阳性并不代表就一定是支原体感染了，有一类你知道宝宝表现为“假阳性”，虽然检查结果是阳性，但是不一定致病。如果确诊支原体感染也不必惊慌，若孩子不发烧，仅咳嗽，完全可以在家口服药物治疗。孩子若发烧较高，可在医院输阿齐霉素治疗。